دانشگاه آزاد اسلامی با عنایت به نوع سیستم آموزشی و اداری منحصر به فرد الزاماً دارای سیستم مدیریتی بسیار پیچیده و موثرتری نسبت به سایر مراکز می‌باشد. نیاز روزافزون به افزایش رشته های تحصیلی، ساخت و ایجاد فضاهای آموزشی و جذب نیروی متخصص به عنوان مهمترین عوامل توسعه هر موسسه آموزشی، تلاش بسیاری از طرف مسئولین و علی‌الخصوص رئیس واحدهای دانشگاه می‌طلبد. همچنین سیستم مالی دانشگاه آزاد اسلامی به لحاظ اینکه هر واحد تقریبا بایستی بصورت مستقل منابع مالی را جذب و رأساً در چارچوب آئین‌نامه‌های سازمان مرکزی و با مسئولیت مستقیم ریاست واحد هزینه نماید، باعث گردیده نقش رئیس واحد در این دانشگاه برجسته‌تر گردد که هم اکنون این مهم به عهده آقای دکتر منوچهر ستاری نایینی می باشد

اهم وظایف واختیارات

• تعیین سیاستهای کلی و خط مشی اجرایی واحد منطبق با ضوابط و مقررات سازمان مرکزی

• نظارت عالیه بر اجرای دستورالعملها، بخشنامه­ها و آیین‌نامه‌های ارسالی و صادره از سوی سازمان مرکزی دانشگاه آزاد اسلامی و صدور دستورالعملهای لازم به منظور هدایت زیر مجموعه.

• عزل و نصب رؤسای دانشکده ها و مدیران گروههای آموزشی و مدیران و مسئولان بخشهای مختلف

• ایجاد وفاق و همدلی بین معاونین و پرسنل در راستای ایجاد بستری آرام و مطمئن

• رهبری و ساماندهی حوزه های آموزشی،پژوهشی، اداری و مالی، دانشجویی، عمران، مدارس سما و دفتر فرهنگ اسلامی

• نظارت برامور و فعالیت های حوزه های آموزشی، پژوهشی، اداری و مالی، دانشجویی، عمرانی، سما ودفتر فرهنگ اسلامی واحد

• انتصاب رؤسای دانشکده ها و مدیران گروه های آموزشی و مدیران و مسئولان بخش های مختلف

• نظارت بر فعالیت های تشکل های دانشجویی وبسیج دانشجویی بر اساس ضوابط شورای عالی انقلاب فرهنگی

• ایجاد زمینه ای توام با آرامش ضمن توسعه امور رفاهی و فرهنگی مناسب

• اعتلای سطح علمی و تخصصی دانشجویان درفضایی که حفاظت از ارزشهای دینی و حراست از دست آوردهای نظام مقدس جمهوری اسلامی ملحوظ باشد.

• نظارت بر حسن اجرای وظایف معاونتها و مدیریتها

• تامین نیروی انسانی لازم در چهارچوب تشکیلات و پست های سازمانی مصوب سازمان

• اتخاذ تصمیم در مورد کلیه فعالیتهای اداری و مالی، آموزشی، فرهنگی ودانشجویی